Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tsg101Q61187 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tsg101Q61187 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tsg101Q61187 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tsg101Q61187 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tsg101Q61187 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tsg101Q61187 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tsg101Q61187 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tsg101Q61187 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tsg101Q61187 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tsg101Q61187 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tsg101Q61187 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tsg101Q61187 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tsg101Q61187 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms