Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PapolaQ61183 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PapolaQ61183 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PapolaQ61183 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms