Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift20Q61025 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ift20Q61025 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift20Q61025 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms