Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp4Q60972 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbbp4Q60972 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp4Q60972 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp4Q60972 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms