Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DbpQ60925 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbpQ60925 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DbpQ60925 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DbpQ60925 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DbpQ60925 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DbpQ60925 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DbpQ60925 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DbpQ60925 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DbpQ60925 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DbpQ60925 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DbpQ60925 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbpQ60925 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbpQ60925 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DbpQ60925 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms