Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd4Q60688 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxd4Q60688 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd4Q60688 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms