Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tdrd5Q5VCS6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd5Q5VCS6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd5Q5VCS6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd5Q5VCS6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms