Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NotoQ5TIS6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NotoQ5TIS6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms