Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYH2

Tmem199, Transmembrane protein 199, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem199Q5SYH2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem199Q5SYH2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem199Q5SYH2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem199Q5SYH2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem199Q5SYH2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem199Q5SYH2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem199Q5SYH2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem199Q5SYH2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem199Q5SYH2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem199Q5SYH2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem199Q5SYH2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem199Q5SYH2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem199Q5SYH2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms