Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med13Q5SWW4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med13Q5SWW4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms