Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CluhQ5SW19 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CluhQ5SW19 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CluhQ5SW19 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CluhQ5SW19 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms