Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.1 ms