Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SynrgQ5SV85 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SynrgQ5SV85 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms