Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ankrd40Q5SUE8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ankrd40Q5SUE8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ankrd40Q5SUE8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms