Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71bQ5STT6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Fam71bQ5STT6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam71bQ5STT6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms