Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam46cQ5SSF7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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