Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sun3Q5SS91 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sun3Q5SS91 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sun3Q5SS91 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sun3Q5SS91 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms