Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4930512M02RikQ5SQK8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930512M02RikQ5SQK8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms