Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RilpQ5ND29 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RilpQ5ND29 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RilpQ5ND29 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms