Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsrp1Q5NCR9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nsrp1Q5NCR9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nsrp1Q5NCR9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms