Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCQ5

Dph1, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph1Q5NCQ5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dph1Q5NCQ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dph1Q5NCQ5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dph1Q5NCQ5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dph1Q5NCQ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms