Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim58Q5NCC9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim58Q5NCC9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trim58Q5NCC9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim58Q5NCC9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms