Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Trpm3Q5F4S9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trpm3Q5F4S9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm3Q5F4S9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm3Q5F4S9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms