Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrrc8bQ5DU41 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc8bQ5DU41 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc8bQ5DU41 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms