Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

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Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp22Q5DU02 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Usp22Q5DU02 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp22Q5DU02 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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