Protein–RNA interactions for Protein: Q5BL07

Pex1, Peroxisome biogenesis factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex1Q5BL07 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pex1Q5BL07 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pex1Q5BL07 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pex1Q5BL07 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms