Protein–RNA interactions for Protein: Q59IW6

Abi3bp, ABI gene family, member 3 (NESH)-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abi3bpQ59IW6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abi3bpQ59IW6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abi3bpQ59IW6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abi3bpQ59IW6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abi3bpQ59IW6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abi3bpQ59IW6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abi3bpQ59IW6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms