Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1td1Q587J6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
L1td1Q587J6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
L1td1Q587J6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms