Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q504N7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q504N7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q504N7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q504N7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q504N7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q504N7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q504N7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q504N7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q504N7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q504N7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q504N7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q504N7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q504N7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q504N7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q504N7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q504N7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q504N7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q504N7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q504N7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q504N7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q504N7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q504N7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q504N7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q504N7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q504N7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q504N7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q504N7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q504N7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q504N7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q504N7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q504N7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q504N7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q504N7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q504N7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q504N7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q504N7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q504N7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q504N7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q504N7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q504N7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q504N7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q504N7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q504N7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q504N7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q504N7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q504N7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q504N7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q504N7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q504N7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q504N7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q504N7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q504N7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q504N7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q504N7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q504N7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q504N7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q504N7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q504N7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q504N7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q504N7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q504N7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q504N7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q504N7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q504N7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q504N7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q504N7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q504N7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q504N7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q504N7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q504N7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q504N7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q504N7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q504N7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q504N7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q504N7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q504N7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q504N7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q504N7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q504N7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q504N7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q504N7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q504N7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q504N7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q504N7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q504N7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q504N7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q504N7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q504N7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q504N7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q504N7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q504N7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q504N7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q504N7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q504N7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q504N7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q504N7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q504N7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q504N7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q504N7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 298.7 ms