Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN81

H2-Q2, Histocompatibility 2, Q region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q2Q4KN81 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
H2-Q2Q4KN81 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-Q2Q4KN81 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q2Q4KN81 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q2Q4KN81 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms