Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc3lQ4KL14 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc3lQ4KL14 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc3lQ4KL14 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc3lQ4KL14 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms