Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmub2Q3V209 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmub2Q3V209 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmub2Q3V209 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms