Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms