Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim80Q3V061 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim80Q3V061 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim80Q3V061 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim80Q3V061 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim80Q3V061 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim80Q3V061 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms