Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc9Q3V038 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc9Q3V038 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc9Q3V038 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms