Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrfip1Q3UZ39 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrfip1Q3UZ39 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrfip1Q3UZ39 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms