Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc160Q3UYG1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc160Q3UYG1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms