Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3l2Q3UXB0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd3l2Q3UXB0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms