Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhdc9Q3USL1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhdc9Q3USL1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Klhdc9Q3USL1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhdc9Q3USL1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 320 ms