Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms