Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam198bQ3UPI1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam198bQ3UPI1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam198bQ3UPI1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Fam198bQ3UPI1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fam198bQ3UPI1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam198bQ3UPI1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam198bQ3UPI1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam198bQ3UPI1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam198bQ3UPI1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam198bQ3UPI1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam198bQ3UPI1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms