Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skap2Q3UND0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skap2Q3UND0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap2Q3UND0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skap2Q3UND0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms