Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp30Q3UN04 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp30Q3UN04 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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