Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Sf3b2Q3UJB0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sf3b2Q3UJB0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sf3b2Q3UJB0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms