Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pitpnm3Q3UHE1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pitpnm3Q3UHE1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms