Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LbrQ3U9G9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LbrQ3U9G9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LbrQ3U9G9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LbrQ3U9G9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms