Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cops9Q3U898 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cops9Q3U898 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cops9Q3U898 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cops9Q3U898 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cops9Q3U898 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cops9Q3U898 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cops9Q3U898 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Cops9Q3U898 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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Cops9Q3U898 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cops9Q3U898 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cops9Q3U898 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cops9Q3U898 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cops9Q3U898 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cops9Q3U898 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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