Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rnf180Q3U827 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rnf180Q3U827 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Rnf180Q3U827 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf180Q3U827 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
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