Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssbp4Q3U4B1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp4Q3U4B1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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