Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ulk3Q3U3Q1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ulk3Q3U3Q1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms